三方物流企業的核心競爭力是企業獨有的，不容易被競爭對手模仿。物流企業為了保持其核心競爭力，必須不斷滿足市場和客戶的新需求，開展增值服務，其本質是持續創新。

第三方物流企業的創新能力著重是體制創新，對中國許多傳統物流企業來說，可以通過資產重組、股份制改造、合資合作等方式完善公司治理結構，實現企業體制創新。二是組織創新，建立基于信息平臺、具有快速反應能力的扁平化物流組織結構，以適應流程化管理和決策權限前進和分散的需要。三是服務內容的創新，從單一功能的服務擴展到可以根據核心業務提供整個物流方案的實施服務。

運營能力

物流服務無法保存，所以服務流程是客戶的消費流程，任何錯誤都會對客戶產生不利影響。 物流企業只有很高的業務運營能力，才能以低成本實現高水平的服務目的。因此物流運營能力是物流企業基本不可或缺的能力，是物流企業競爭優勢的基本體現。

物流業務運營的內容分為三個層次：一是物流實施方案整體的運營能力，這要求各功能業務互相合作，緊密聯系，高效運營，保證整個過程低成本高效進行。

三方物流二是具體物流功能業務的運營，這要求具體物流功能內部的各工作環節、運營效率、準確、安全。三是具體作業(操作)的運營，具體包括科學工作和作業方法的制定、先進的作業時間分配和操作規范的決定等。